Como he comentado en post anteriores, la decisión sobre el mejor editor depende enteramente de tus necesidades, lo mejor seria probarlos y decidir, aun asi, puedo comentar mi opinión en base a investigación, lectura y experiencia.
Los editores se pueden evaluar en base a velocidad de desempeño, funcionalidades incluidas, curva de aprendizaje, y soporte.
A nivel de velocidad de desempeño, el ganador es Sublime, sin embargo, si uno se pone a detallar los cambios realizados de version a version por atom, se puede ver que estan trabajando en mejorar cada vez en este como otros aspectos.
Con respecto a las funcionalidades incluidas, de acuerdo a mi experiencia Atom es mucho mejor ya que trae muchas cosas por default, su rango de predicción de gramáticas es mucho más completo sin necesidad de instalar paquetes adicionales.
En el tema de curva de aprendizaje, debo decir que me inclino más por Atom, tiene un gran manual de ayuda, muy completo en el que te explican desde como instalarlo hasta cómo crear paquetes y temas, antes de Atom cuando usaba Sublime los primeros meses recuerdo estar trabajando casi como si fuera un block de notas más, no tenía una idea clara de como instalar paquetes y mejoras, sin embargo, con Atom fue muy sencillo. Y bracket aunque al igual que Atom es código abierto no posee tantas extensiones actualmente com Atom.
Y por último el soporte, de los tres programas Sublime es el que posee la menor comunidad y grupo de desarrollo, ya que Atom y Brackets pertenecen a GitHub y Adobe respectivamente, y si a eso le sumamos el hecho de que no es código abierto, lo hace el que menos soporte provee y depende completamente del desarrollador del programa para la solución de cualquier inconveniente.